1. 新世纪高等农林教育教学改革工程”课题--植物生产类人才培养方案的研究与实践，教育部，2000-2004年

    2. “新世纪高等农林教育教学改革工程”课题--农林科“双基实验室”资源优化与运行机制的研究与实践，教育部，2000-2004年

    3. “高等学校本科教学质量与教学改革工程”项目——植物生产类复合型拔尖人才培养模式创新实验区，教育部，2007

    4. “新世纪高等教育教学改革工程”课题--加强大学生创新能力培养，建设“植保”品牌专业，教育厅，2002-2004

    5. “新世纪高等教育教学改革工程”课题--园艺应用型本科人才培养规格、模式、方案及其实践的研究，教育厅，2002-2004

    6. “新世纪高等教育教学改革工程”课题--农村区域发展专业课程体系与手段创新研究，教育厅，2002-2004

    7. “新世纪高等教育教学改革工程”课题--南京农业大学“园艺学”品牌专业的建设研究与实践，教育厅，2002-2004

    8. “新世纪高等教育教学改革工程”课题--高等农林院校实验室管理体制改革的研究，教育厅，2002-2004

    9. 江苏省教育科学“十五”规划课题—园艺学科大学生创新教育研究与实践，教育厅，2003—2005

    10. 江苏省高等教育教学改革研究项目—加强大学生毕业论文教学环节的研究与实践，教育厅， 2005-2007

    11. 江苏省高等教育教学改革研究项目—园艺专业精品课程建设实践和研究，教育厅，2005-2007

    12. 江苏省高等教育教学改革研究项目—与研究型大学相适应的大学生科研训练（SRT）计划实践模式的探索，教育厅，2005-2007

    13. “十一五”高等教育科学研究规划课题—通过大学生科研训练（SRT）计划培养农业应用型本科人才的探索，江苏省高教学会，2006—2007

    14. “十一五”高等教育科学研究规划课题—中国高校科技产业化机制和实证研究，中国高教学会，2006—2007

    15. “十一五”高等教育科学研究规划课题—作物栽培学开放式实验教学研究，中国高教学会，2006—2007

    16. “十一五”高等教育科学研究规划课题—创新型生物学本科人才培养与深化高等教育教学改革研究，中国高教学会，2006—2007

    17. 江苏省高等教育教学改革研究项目—园艺专业产学研一体化办学模式的探索与实践，教育厅，2007-2008

    18. 作物栽培学数字化辅助教学系统的研究，南京农业大学，2002-2004。

    19. 以特色促创新，以手段促质量，切实培养学生实际动手能力，南京农业大学，2002-2004。

    20. “植物病理学”课程群创新人才培养工程建设体系研究，南京农业大学，2002-2004。

    21. “昆虫学”课程群建设的研究与实践，南京农业大学，2002-2004。

    22. 强化植物生产类专业综合性和设计性实验教学的研究与实践，南京农业大学，2005-2006。

    23. 农村区域发展专业实践教学体系创新研究，南京农业大学，2005-2006。

    24. 植物保护专业教学生产实习的优化与改革研究，南京农业大学，2005-2006。

    25. 植物化学保护实验教学的改革与创新研究，南京农业大学，2005-2006。

    26. 高素质生物学本科生与研究生贯通培养的思路与模式研究，南京农业大学，2005-2006。

    27. 作物栽培学实验教学方法的创新研究，南京农业大学，2006。

    28. 遗传学实验课课程模式改革，南京农业大学，2006。

    29. 注重科学研究能力培养的导师制保障措施研究，南京农业大学，2005-2007。

    30. 植物病理学专业高素质本科生与研究生贯通培养的思路与模式研究，南京农业大学，2005-2007。

    31. 中美两国大学昆虫学教育体系和人才培养模式的比较研究，南京农业大学，2005-2007。

    32. 高校本科教学教师团队建设研究，南京农业大学，2007-2008。

    33. 农科类大学生科研训练（SRT）计划的实施策略研究，南京农业大学，2007-2008。